Transposon vs Retrotransposon
Transpozoni in retrotranspozoni so genetske komponente DNK in med njimi obstajajo velike razlike. Odstotek prisotnosti teh genskih materialov se med vrstami razlikuje, njihove funkcije pa določajo usode organizma z mutacijami in drugimi fenotipsko pomembnimi spremembami. Transpozoni in retrotranspozoni so geni ali zbirke nekaterih genov, ki se nahajajo v verigah DNA, in spremembe njihovih lokacij so bile glavni vzrok za te posledice. Namen tega članka je na kratko razpravljati o delovanju teh genov in predstavlja primerjavo med transpozoni in retrotranspozoni.
Kaj je zdravilo Transposon?
Transpozoni so zanimivi fragmenti ali segmenti DNA s sposobnostjo spreminjanja lokacije verige DNA v obliki mehanizma za rezanje in lepljenje. Zaradi te mobilne narave transpozonov so ti znani kot skakalni geni. Transpozoni so dveh glavnih vrst, znani kot Transpozoni razreda I in Transpozoni razreda II. Običajno se tip razreda II imenuje transpozoni, razred razreda I pa kot retrotranspozoni. Procese rezanja in lepljenja mobilnih segmentov DNA uravnava encim transpozaza. Encim se veže na oba konca transpozona in prereže fosfodiesterske vezi verige DNA, izolira transposon, ga premakne na ciljno mesto in veže na novem mestu. Vendar je ta proces zanimiv za razumevanje,saj se lahko nekateri transpozoni premaknejo na določena mesta samo zaradi nezdružljivosti osnovnih zaporedij s ciljnim mestom. Geni z enim koncem ene same verige imajo enako bazno zaporedje z drugim koncem druge posamezne verige so transpozoni z lepljivimi robovi, ker se ti lahko vežejo na mesta ciljne verige DNA z enakim osnovnim zaporedjem kot na lepljivih koncih. Vendar pa lahko ta mobilnost genov povzroči spremembe tako genotipa kot tudi fenotipa organizma. Nato so bili na voljo znanstveniki, ki so izumili transpozone in gensko spremenjeno hrano ter organizme v skladu s prednostnimi prilagoditvami. Visoko produktivni kmetijski pridelki, antibiotiki z zdravilnimi lastnostmi,Živinorejske živali so bile nekateri izredno razviti proizvodi po izumu transpozonov, ki ga je Barbara McClintock izumila v 40. letih.
Kaj je Retrotransposon?
Retrotranspozoni so transpozoni razreda I, ki se skozi genom premikajo po mehanizmu kopiranja in lepljenja. Mehanizem mobilnosti retrotranspozonov vključuje nekaj večjih korakov, kot so kopiranje genskega segmenta verige DNA v RNA, prenos kopije RNA na ciljno mesto, transkripcija zaporedja RNA nazaj v DNA z uporabo reverzne transkriptaze in vstavljanje gena na novo lokacijo verige DNA genoma. Oba konca teh retrotranspozonov imata ponavadi dolge končne ponovitve s približno 1000 baznimi pari, ki se uporabljajo kot identifikacijske značilnosti teh genov. Ti geni se enostavno ojačajo znotraj genoma, odstotek retrotranspozonov v človeškem genomu pa je približno 50%. Ti so lahko precej nevarni, saj je povzročitelj virusa AIDS-a, HIV-a,in virus T-celične levkemije imajo retrotranspozone v svojih genomih RNA. Dejansko lahko ti virusi z uporabo reverzne transkriptaze in integraze vežejo retrotranspozone na katero koli mesto verig človeške DNA. Encim integraza deluje enako kot transpozaza pri transpozonih razreda II.
Kakšna je razlika med zdravilom Transposon in Retrotransposon?
• Transpozoni so skakalni geni razreda II, medtem ko retrotranspozoni spadajo v kategorijo razreda I.
• Transpozoni delujejo z encimom transpozaze, medtem ko retrotranspozoni delujejo z uporabo dveh glavnih encimov, znanih kot reverzna transkriptaza in integraza.
• Konci terminalov so pri retrotranspozonih veliko daljši kot pri transpozonih.
• Transpozoni so odrezani od izvora in prilepljeni na tarčo; nasprotno pa se retrotransponi kopirajo iz izvora v RNA in prepišejo na tarčo.
• Premikanje retrotranspozonov vključuje RNA, ne pa tudi transpozonov.
